整整七次进攻在葡萄牙人和科钦守军的奋勇抵抗下全部失败，根据统计，单是直接死亡者就超过五千人，受伤和染上霍乱等疫病者保守估计也已经过万，再加上逃兵，所有的损失加起来已经让扎莫林带来的五万大军折损近半。
至于卡利卡特的船队，他们因为避战没有遭到额外的损失，这同样意味着他们没有在围攻中发挥应有的用处。
这些挫折加起来让扎莫林无法承受，他的战斗意志已经被在数月间根本没有进展的围攻消磨殆尽，经过几夜的权衡和心理斗争，他最终下令撤军。
先前如潮水般席卷而来的卡利卡特军如今也如潮水般退去，仅留来不及收拢的尸体和军械供胜利者处理。佩雷拉在主楼顶部俯瞰战场，心情舒畅地让书记官写下送回国内的简报。
“在天主的庇佑下，我们成功审慎地运用智慧和力量击败这些邪恶的入侵者，以我主曼努埃尔之名，伟大的葡萄牙将会在印度取得更多胜利。”
葡萄牙人在科钦的胜利引发了马拉巴尔海岸的政治地震，越来越多的人认为这些闯入的外来者是不可战胜的。先是权威丧失殆尽的老扎莫林下令传位给侄子并隐居，同时卡利卡特的附庸城市们则开始和葡萄牙人暗通款曲，开始选择为接下来的战局投注。
同样因为战局失败，大批mu斯林商人对扎莫林丧失信心，开始带着商品和商船离开卡利卡特，前去其他尚未被战火波及的港口。这毫无疑问为卡利卡特的经济给予一记重击。